Після перенесення столиці в Санкт-Петербург Кремль був покинутий. Царський палац після пожежі 1701 р ні восстанавлі і поступово руйнувався. У 1722 р, ймовірно до спланованого коронації Катерини I, Петро наказав оглянути давню споруду і скласти опис та кошторис для його лагодження. Однак значні пошкодження не дозволили виконати необхідні для повного відновлення роботи, тому обмежилися лише частковим ремонтом. Були перекриті покрівлями Архангельський та Благовіщенський собори, наведені в порядок Грановита і Відповідна палати і частина Теремного палацу.
Локальне поновлень проводилися і перед наступними коронації. При Ганні Іоанівна для її тимчасового перебування в Москві в 1730 р навпроти будівлі Арсеналу спорудили невеличкий дерев'яний палац за проектом архітектора В. Растреллі, який називався «Анненгоф».
Імператриця Єлизавета Петрівна побажала мати в Московському Кремлі постійну резиденцію і вирішила спорудити для себе новий палац. Дбаючи про збереження наступності вітчизняних традицій, вона вирішила включити його в комплекс стародавніх царських хором. З цією метою, відповідно до указу імператриці, в 1749 р за кошторисом і кресленнями, складеним архітекторами команди Д. Ухтомського ще в 1747 р, почалася лагодження нижніх ярусів палацового комплексу, побудованого в кінці ХV ст. італійцем Алевизом Новим для Івана III. Новий палац передбачалося поставити на ці підкліть замість застарілих парадних палат старого палацу: Набережних - Столовою і Відповідною і Середньої Золотий.
Автором проекту палацу був архітектор В. Растреллі; нагляд за будівництвом було доручено здійснювати архітектору Д. Ухтомскому, який також брав безпосередню участь і в розробці декоративних деталей для оформлення палацу. Різьблені прикраси виконували різьбярі Зімін. Закінчений будівництвом в 1756 р, він став називатися Кремлівським Зимовим палацом, на відміну від Яузского Головінського, прозивали Літнім.
Новий одноповерховий палац оточувала відкрита тераса, відновлена на аркаді Алевізовского подклета. Споруда мала в плані Г-подібну форму, двома головними фасадами виходячи на набережну Москви-ріки і на Соборну площу. Паралельно корпусу, зверненого до Соборної площі, з західної сторони стояв другий вузький двоповерховий флігель. Палац був виконаний в типових для творчості В. Растреллі барокових формах. Обидва головних фасаду мали симетричну композицію, вони членились на прясла парними напівколонами з різьбленими капітелями, центри фасадів були відзначені ризалитами, завершується фігурними фронтонами зі скульптурним зображенням державного герба. Віконні отвори прикрашали складні наличники з ліпниною. Барокова покрівля з характерним переломом була прикрашена з боку Соборній площі різьбленими картушами, а в центрі над ризалитом височів мансардний поверх. Перед фасадом, що виходив до Москви-ріки, розбили Нижній Набережний сад, виконаний у французькому стилі.
До кінця ХVIII століття палац, знову багато років простояв нежилим, виявився непридатним для житла, був занадто малий і не відповідав моді. До дня коронації Павла I двом архітекторам М.Ф. Казакову і Н.А. Львову доручили виконати проект перебудови палацу, що включав створення нових обсягів. Жоден із створених проектів не був здійснений.
Уже після коронації, в 1798 р за проектом Н.А. Львова було реконструйовано лише спорудження В.В. Растреллі. Надбудова другим поверхом середній частині набережного корпусу, і обробка фасадів в класичному стилі повністю змінили вигляд палацу. Восьмиколонний портик з відкритим балконом нагорі, трикутний фронтон і велике полуциркульное вікно під ним, розташовані по центру фасаду, надавали йому вигляду садибного будинку, а не імператорської резиденції.
У 1812 р будівля постраждала від пожежі, влаштованого в Кремлі відступаючої наполеонівської армією.
До приїзду в Москву Олександра I в серпні 1816 р палац був спішно відновлений московськими архітекторами А.Н. Бакаревим, І.Л. Миронівським і І.Т. Таманським за участю архітектора В.П. Стасова. Однак відновлений палац виявився недостатнім для перебування в ньому імператорської сім'ї зі свитою, тому було вирішено надбудувати весь його обсяг третім поверхом, що і було доручено того ж Стасову. Представлений автором проект перебудови був здійснений в 1817 р Фасади отримали строгі класичні форми. В їх скульптурну обробку були введені мотиви військової атрибутики та зображення перемог.
У міру зростання ролі Москви як колиски російського самодержавства зростали вимоги і до показності Кремля - імператорської резиденції. Старий палац і розмірами і застарілою архітектурою вже не задовольняв запитам часу. У 1839 р Микола I затвердив проект нового Великого Кремлівського палацу архітектора К.А. Тона. Нова резиденція російських імператорів була зведена на місці Зимового палацу, розібраного разом з подклетом і аркадою кінця ХV ст.
