До середини V ст. Вірменська Апостольська Церква являла одну з гілок єдиної християнської Церкви. Однак, прагнучи зміцнити свою незалежність від Візантії і, не визнавши рішень IV (Халкідонського) Вселенського Собору (451 р), Вірменська Апостольська Церква фактично відокремилася і від Східної, і від Західної Церкви.
Вірменська церква відрізняється і від православної, католицької та протестантської церков. Вона відноситься до розряду, так званих, монофізитських церков. Тоді як Православна - до діофізітскім. Діофізітов визнають в Христі два начала - людське і божественне; монофізити - тільки божественне. Щодо семи таїнств, Вірменська церква тримається особливих правил. А саме: при хрещенні немовля тричі обприскується і тричі занурюється в воду; миропомазання пов'язане з хрещенням; при причасті вживається тільки чисте незмішані вино і квашений (бездріжджовий) хліб, помоченний у вині, соборують тільки духовних осіб негайно після смерті.
Вірмени вірять в святих, але не вірять в чистилище. Пости вірмени дотримуються також строго, але свят у них менше. Головною, прийнятої в Вірменської церкви молитвою, є Хайр Мер (Отче Наш), вона читається на древнеармянском мовою.
Католикос обирається на Ечміадзинського синоді, куди запрошуються депутати від всіх російських і іноземних вірменських єпархій, і затверджується особливої грамотою Государем Імператором.
Католикос живе в Ечміадзині на Арараті, куди кожен вірменин повинен з'їздити хоч раз в житті. Вірменські архієпископи і єпископи можуть бути висвячені тільки Католикосом. Світське духовенство може вступати в шлюб тільки один раз, другий шлюб не дозволяється.
Родинними монофізітській церквами Вірменської Апостольської церкви є Коптська (Єгипет), Ефіопська і яковитский (Сирія).