Одна з перших згадок про Балаклаві , Дійшли до наших днів, можна знайти в поемі Гомера "Одіссея", в ній Гомер описує події 12 столітті до нашої ери: "У гавань красиву там ми увійшли. Її оточують
Скелі з обох сторін безперервної стіною.
Біля входу високо здіймаються один проти одного
Два вибігали мису, і вузький вхід в цю гавань.
Там плем'я ми зустріли кровожерливе Лестригони "
Як сходяться історики - це було плем'я Тавров, що мешкали в той час в цих місцях.
Друга згадка про Балаклаву, теж знаходиться в грецькому епосі, про двох друзів арешт і Пілата які прибули сюди через 10 років після висадки Одіссея. На берегах Бадаклави, де живуть кровожерливі лістригони, їм потрібно було викрасти статую Артеміди.
Перше грецька назва Балаклави - Сюмболон Лімен, що означає "Бухта ознаки".
Наступне назву, яке зустрічається в історії - це назва, під яким ми зараз і знаємо місто, Балаклава. Назва Балаклава має два переклади з татарської - "риб'яче гніздо" і "Рибна погода".
Перша історична згадка про Балаклаві датується 1 століттям н.е. Плінієм Старшим. Подорожуючи по Тавриді (одне з перших назв Криму, яка проіснувала до середньовіччя), описує Балаклаву як рибальське селище і місцем збору піратів.
В кінці 1-го століття нашої ери, римське військо під проводом Плавтія Сільвана перемогло Тавро- скіфів під Херсонесом. Після перемоги римляни зводять в Балаклаві храм Юпітеру і називають місто Сюмболон.
У 145 році н.е. імператор Антонін Пій допомагає правителям Херсонеса в боях із залишками Тавров і скіфів, останні були відкинуті в північну і східну частину Криму. В цей час в Балаклаві посилюється фортеця і зміцнюється римське панування. Всі важливі посади займають римляни, греки займаються в основному торгівлею. Римляни живуть в Балаклаві до 240 року, в цьому році вони залишають територію Таврії і передають місто грекам.
У 1204 р впала Візантія і генуезці захопили торгові шляхи до Криму. У Балаклаві починають будувати фортецю і захисні споруди для охорони торгових суден, фортеця носить стратегічне призначення, є ключем до столиці, Херсонесу. У Балаклавській бухті постійно несуть чергування військові кораблі, готові в будь-який момент відбити ворожий напад.
У 1475 р місто, після довгої облоги, упав під натиском Османської імперії, літописці приписують до цього періоду поява першої згадки назви Балікайя. І на довгі роки Османська імперія закріпилася там.
У 1624 р Балаклаву захопили козаки, місто було частково розграбований, грецькі поселення в місті практично не постраждали, Османа були розграбовані і спалені. Фортеця і місто козаки довго не утримували, після розграбування повернулися з награбованим в свою столицю, на острів Хортицю.
У 1773 році 23 червня турецькі кораблі були атаковані біля Балаклави 2-ма російськими кораблями "Корона" і "Таганрог", і після 6 години битви турецькі кораблі повністю розгромлені - відступили. Це була перша Російсько-Турецька Війна і перша морська перемога на Чорному морі, виграна в меншості вона принесла велику славу Російському морському флоту. Після битви Балаклава стала першим в історії портом Російського флоту на території Криму.
У 1787 р Балаклаву відвідала Імператриця Катерина II, вона писала, що Балаклава це ключ до Криму і розпорядилася облаштувати військові укріплення.
У 1854 р, в жовтні, в Балаклаву увійшла ескадра Англійського морського флоту, після запеклого опору частина оборонялися здалася, частина зумівши вибратися з оточення дісталася до місця базування російської армії в Ялті. Ті, хто здався на милість переможців, були або вбиті або займалися чорновими роботами по відновленню або облаштування міста.
У 1855р. біля Балаклави відбулося криваве бій, хоча російські війська не здобули в ньому перемоги, бойовий дух англійців був пригнічений, з величезними втратами англійці утримали Балаклаву, а місце битви назвали "Долина смерті".
Під час перебування англійців в Балаклаві, була відбудована перша дерев'яна набережна в місті, пізніше вона стала називатися набережній Назукіна. З'явилося безліч торгових лавок, ремісників.
В цей же час англійці почали будівництво першої залізниці в Криму, вона з'єднувала Сапун-гору з Балаклавою, протяжність склала практично 13 км.
Протягом усього періоду перебування англійців, в місті весь час було неспокійно, постійні вбивства, шибениця не пустувала і на день. Англійські матроси, по одному практично не переміщалися по місту, а в околиці виходили тільки групами, дуже сильне було опір місцевими жителями.
Уже в 1856 році порт в спішному порядку покидають англійці, місто практично заново розграбували, а відбудовану залізницю розібрали і продали туркам.
Відновлення міста повністю завершилося в 1871 році, місто стає одним з популярних курортів російської аристократії.
У 1887 в місті була відкрита перша гостинця "Гранд Готель" і через рік князь Юсупов побудував на протилежному березі бухти мисливський будиночок, Балаклава набирає свою популярність.
В період 1-ї світової війни Балаклава була окупована Німеччиною, потім перейшла під інтервенцію Франції і в двадцяті роки перейшла під владу більшовиків. Населення міста було не велике, з початком першої світової війни близько 400 осіб. Місто практично спорожнів.
У 1931 році було побудовано перше водолазне училище в СРСР, місто знову як фенікс відроджувався.
У період Другої світової війни оборону міста тримали майже рік, російські війська залишили місто практично стертим з лиця землі.
У 1945 році місто відвідав англійський прем'єр Уїнстон Черчілль, з коротким візитом, вшанувати пам'ять війнам загиблим в "Долині смерті".

У 1953 - 63 рр. в Балаклаві побудована під скелею база для підводних човнів, секретне назва - «Об'єкт 825 ГТС» , Одне з монументальних споруд СРСР. Там знаходилися тактичні підводні човни з ядерною зброєю.
У 1957 р Балаклаву через секретність об'єкта перевели під юрисдикцію р Севастополь .
У 1990, після розпаду СРСР, Балаклава увійшла до складу України, секретний бункер був розграбований, кораблі РФ, були передислоковані на інші бази РФ.
В 2014 році Балаклава разом з Кримом увійшла до складу РФ і отримала новий виток своєї історії.
Балаклава на карті Криму