У 2009 році в Чехії тривало наростання екстремізму, були зареєстровані випадки серйозного обмеження прав дітей ув'язнених, порушувалися права циган та іноземців. Вельми тривожна, на думку працівників Чеського гельсінської комітету, ситуація з дотриманням прав інвалідів та психічно хворих, не піддаються викоріненню прояви дискримінації в сфері освіти.
«У повідомленні звертається увага на недбайливе ставлення державних органів до виконання міжнародних договорів, підписаних чеським державою в сфері захисту прав 
Анна Шабатова людини. Критиці також піддається ставлення деяких вищих представників держави до проблеми захисту прав людини », - коментує Анна Шабатова, голова Чеського гельсінської комітету.
Через відсутність закону про безоплатну правову допомогу, серйозні проблеми спостерігаються в сфері правового захисту незаможних громадян. Незважаючи на те, що в Чехії, після тривалих зволікань все-таки був прийнятий анти-дискримінаційний закон, більшість людей, які не відчуваючи відповідної підтримки від державних інстанцій, відмовляється від захисту своїх прав. Як підкреслює голова Чеського гельсінської комітету Ганна Шабатова, чверть громадян, чиї права були ущемлені, здаються і не вживають подальших дій, що, природно, йде на руку їхнім кривдникам.
Як зазначено в Повідомленні про дотримання прав людини, в 2009 році в Чехії наростала ксенофобія і нетерпимість. У Чеській Республіці тривав підйом екстремізму, що виявляється в радикалізмі неонацистів. Найстрашнішим прикладом цього можна назвати підпал будинку циганської родини в місті Витків, в результаті якого дворічна дівчинка отримала опіки на 80% тіла і вижила лише дивом. 
Чеський гельсінська комітет звертає увагу на те, що це лише «вершина айсберга». Інші випадки були класифіковані поліцією лише як хуліганство, а не спроба скоєння вбивства. До сих пір залишаються безкарними і винуватці інцидентів в місті Литвинов, в кварталі Янов, де представники нині вже розпущеної Робочої партії влаштували антициганські марші. Неприпустимі висловлювання представників суспільного життя країни дають привід задуматися про інституціоналізації расизму.
«Політики, лише за деяким винятком, вдають, що не мають відношення до даних Чехією міжнародним зобов'язанням. Навпаки, своїми злісними виступами створюють атмосферу, яка погіршує ситуацію. І молодчики з Виткова, якби вони не чули подібних речей від вчителів, будинку або ж від політиків, швидше за все, такого ніколи б не зробили ».
Через економічну кризу погіршився і положення іноземців. Процес визначення на роботу переселенців, на думку Чеського гельсінської комітету, у багатьох випадках вийшов з-під контролю держави. Знову наростає нелегальне працевлаштування, при якому іноземці змушені погоджуватися на практично рабські умови. Жодне трудове агентство в 2009 
Будинок в містечку Витків (Фото: www.hzsmsk.cz) року не втратило ліцензії, хоча і було викрито в серйозних порушеннях. Найбільш незахищеними виявилися некваліфіковані працівники, в основному вихідці з Монголії і В'єтнаму, з числа тих, хто не скористався Програмою добровільного повернення на батьківщину. Критиці з боку Чеського гельсінської комітету також була піддана і практично недіюча система так званих «зелених карт». Формальними залишаються і старання в сфері інтеграції іноземців через відсутність дієвої концепції, зазначено в Повідомленні про дотримання прав людини за 2009 рік.
До сих пір в Чеській Республіці залишається актуальною тема порушення дитячих прав у сфері доступності освіти.
«Не у всіх чеських дітей рівні шанси на отримання освіти. Найгірша ситуація з циганськими дітьми, хоча мова йде не тільки про них. Варто згадати дітей-інвалідів, дітей іноземних громадян. Незважаючи на те, що за останні п'ять років в країні вже навчилися відкрито говорити про проблеми, рішень ніхто не пропонує. Такий стан речей заслуговує лише критику », - вважає Давив Загуменскій, директор організації Ліга з прав людини, яка також брала участь у складанні Повідомлення Чеського гельсінської комітету про дотримання прав людини в Чехії за 2009 рік.
Фото: Європейська комісія Зокрема, циганські діти систематично переводяться в школи, де вчаться діти з легкими ментальними відхиленнями. Необгрунтовано багато неповнолітніх виховується в спеціалізованих інтернатах чи дитячих будинках. Недостатньо розвинена система допомоги молодим людям, котрі залишають стіни державних виховних установ.
Одночасно звертається увага на відсутність спеціального закону про соціальне житло, який міг би допомогти забезпечить право на гідні умови життя і задоволення основних людських потреб.
«Причиною складної соціальної ситуації багатьох сімей часто є саме відсутність житла. Сім'я може позбутися житла з власної вини або ж за збігом інших обставин, але при цьому добре дбає про своїх дітей. Відсутність житла, навіть в результаті боргів, не може бути причиною позбавлення батьківських прав та влаштування дітей до виховних установи », - вважає Мартіна Штепанкова з Консультації по громадянству і прав людини.
Мартіна Штепанкова В унісон з омбудсменом, Чеський гельсінська комітет критикує переповненість в'язниць (нині чеські в'язниці переповнені на 30%) і тривалі терміни ув'язнення. Констатується недостатня кількість різних реабілітаційних програм, які б допомагали підготувати до нормального життя тих, хто виходить зі стін виправних установ. Хворий темою залишається і недостатній контакт дітей з батьками, які опинилися в ув'язненні.
Зачіпає Повідомлення Чеського гельсінського комітету та низький рівень уваги до проблеми нападів, таємниці яких є нетерпимість до сексуальної орієнтації жертви. Даний мотив вважається обтяжуючою, але не веде до посилення покарання винного, як це відбувається в разі расистського нападу. Звертається увага і на недосконалість закону про зареєстроване партнерство, який позбавляє зареєстровані гомосексуальні пари права на усиновлення дитини. При цьому одинак, будь-якої орієнтації, може усиновити дитину при дотриманні встановлених умов.
